Home
Giới thiệu
Tài khoản
Đăng nhập
Quên mật khẩu
Đổi mật khẩu
Đăng ký tạo tài khoản
Liệt kê
Công trình khoa học
Bài báo trong nước
Bài báo quốc tế
Sách và giáo trình
Thống kê
Công trình khoa học
Bài báo khoa học
Sách và giáo trình
Giáo sư
Phó giáo sư
Tiến sĩ
Thạc sĩ
Lĩnh vực nghiên cứu
Tìm kiếm
Cá nhân
Nội dung
Góp ý
Hiệu chỉnh lý lịch
Thông tin chung
English
Đề tài NC khoa học
Bài báo, báo cáo khoa học
Hướng dẫn Sau đại học
Sách và giáo trình
Các học phần và môn giảng dạy
Giải thưởng khoa học, Phát minh, sáng chế
Khen thưởng
Thông tin khác
Tài liệu tham khảo
Hiệu chỉnh
Số người truy cập: 109,882,178
Three marine species of the genus Fulvivirga, rich sources of carbohydrate active-enzymes degrading alginate, chitin, laminarin, starch and xylan.
Tác giả hoặc Nhóm tác giả:
Tra T.H. Nguyen, Tien Q. Vuong,
Ho Le Han
, Zhun Li, Yong-Jae Lee, Jaeho Ko, Olga I.Nedashkovskaya & Song- Gun Kim
Nơi đăng:
Scientific Reports (Nature porfolio);
S
ố:
13;
Từ->đến trang
: 6301;
Năm:
2023
Lĩnh vực:
Khoa học;
Loại:
Bài báo khoa học;
Thể loại:
Quốc tế
TÓM TẮT
Bacteroidota is a group of marine polysaccharide degraders, which play a crucial role in the carbon cycle in the marine ecosystems. In this study, three novel gliding strains, designated as SS9‑22T, W9P‑ 11T, and SW1‑E11T, isolated from algae and decaying wood were proposed to represent three novel species of the genus Fulvivirga. We identifed a large number of genes encoding for carbohydrate‑active enzymes, which potentially participate in polysaccharide degradation, based on whole genome sequencing. The 16S rRNA sequence similarities among them were 94.4–97.2%, and against existing species in the genus Fulvivirga 93.1–99.8%. The complete genomes of strains SS9‑22T, W9P‑11T, and SW1‑E11T comprised one circular chromosome with size of 6.98, 6.52, and 6.39 Mb, respectively; the GC contents were 41.9%, 39.0%, and 38.1%, respectively. The average nucleotide identity and the digital DNA‑DNA hybridization values with members in the genus Fulvivirga including the isolates were in a range of 68.9–85.4% and 17.1–29.7%, respectively, which are low for the proposal of novel species. Genomic mining in three genomes identifed hundreds of carbohydrate‑active enzymes (CAZymes) covering up to 93 CAZyme families and 58–70 CAZyme gene clusters, exceeding the numbers of genes present in the other species of the genus Fulvivirga. Polysaccharides of alginate, chitin, laminarin, starch, and xylan were degraded in vitro, highlighting that the three strains are rich sources of CAZymes of polysaccharide degraders for biotechnological applications. The phenotypic,biochemical, chemotaxonomic, and genomic characteristics supported the proposal of three novel species in the genus Fulvivirga, for which the names Fulvivirga ulvae sp. nov. (SS9‑22T = KCTC 82072T =GDMCC 1.2804T), Fulvivirga ligni sp. nov. (W9P‑11T = KCTC 72992T =GDMCC 1.2803T), and Fulvivirga maritima sp. nov. (SW1‑E11T = KCTC 72832T =GDMCC 1.2802T) are proposed.
ABSTRACT
[
scientific_reports.pdf
]
© Đại học Đà Nẵng
Địa chỉ: 41 Lê Duẩn Thành phố Đà Nẵng
Điện thoại: (84) 0236 3822 041 ; Email: dhdn@ac.udn.vn