Home
Giới thiệu
Tài khoản
Đăng nhập
Quên mật khẩu
Đổi mật khẩu
Đăng ký tạo tài khoản
Liệt kê
Công trình khoa học
Bài báo trong nước
Bài báo quốc tế
Sách và giáo trình
Thống kê
Công trình khoa học
Bài báo khoa học
Sách và giáo trình
Giáo sư
Phó giáo sư
Tiến sĩ
Thạc sĩ
Lĩnh vực nghiên cứu
Tìm kiếm
Cá nhân
Nội dung
Góp ý
Hiệu chỉnh lý lịch
Thông tin chung
English
Đề tài NC khoa học
Bài báo, báo cáo khoa học
Hướng dẫn Sau đại học
Sách và giáo trình
Các học phần và môn giảng dạy
Giải thưởng khoa học, Phát minh, sáng chế
Khen thưởng
Thông tin khác
Tài liệu tham khảo
Hiệu chỉnh
Số người truy cập: 109,894,753
DNA signaturing derived from the internal transcribed spacer 2 (ITS2): a novel tool for identifying Desmodesmus species (Scenedesmaceae, Chlorophyta)
Tác giả hoặc Nhóm tác giả:
Minh Ly Nguyen, Xuan Cuong Mai, Nhat Ha Chu, Dang Mau Trinh, Chao-Lin Liu, Chia-Rui Shen
Nơi đăng:
Fottea;
S
ố:
23(1);
Từ->đến trang
: 1-7;
Năm:
2023
Lĩnh vực:
Nông lâm ngư;
Loại:
Bài báo khoa học;
Thể loại:
Quốc tế
TÓM TẮT
The freshwater green algal genus
Desmodesmus
contains many cryptic species that are difficult to identify using morpho-anatomy. This study analyzed 310 ITS2 sequences related to
Desmodesmus
species from GenBank and developed a new tool named DNA signaturing. DNA signaturing is a species identification method using signature sequences specific for each species or strain group within the genus
Desmodesmus
. These signature sequences had 18-33 nucleotides in length. This tool could exactly identify 19 species and 24 strain groups of
Desmodesmus
. In addition, a signature sequence, AGA GGC TTA AAC TGG GAC C, was specific for almost 90% of
Desmodesmus
strains and could represent the genus
Desmodesmus
. A strain MLC1 isolated from freshwater in Da Nang, Vietnam, was identified as
Desmodesus pseudoserratus
by this tool. DNA signaturing tool described here showed the highest efficacy for identifying strains and a remarkable ability to accurately classify cryptic species in the genus
Desmodesmus
.
ABSTRACT
The freshwater green algal genus
Desmodesmus
contains many cryptic species that are difficult to identify using morpho-anatomy. This study analyzed 310 ITS2 sequences related to
Desmodesmus
species from GenBank and developed a new tool named DNA signaturing. DNA signaturing is a species identification method using signature sequences specific for each species or strain group within the genus
Desmodesmus
. These signature sequences had 18-33 nucleotides in length. This tool could exactly identify 19 species and 24 strain groups of
Desmodesmus
. In addition, a signature sequence, AGA GGC TTA AAC TGG GAC C, was specific for almost 90% of
Desmodesmus
strains and could represent the genus
Desmodesmus
. A strain MLC1 isolated from freshwater in Da Nang, Vietnam, was identified as
Desmodesus pseudoserratus
by this tool. DNA signaturing tool described here showed the highest efficacy for identifying strains and a remarkable ability to accurately classify cryptic species in the genus
Desmodesmus
.
© Đại học Đà Nẵng
Địa chỉ: 41 Lê Duẩn Thành phố Đà Nẵng
Điện thoại: (84) 0236 3822 041 ; Email: dhdn@ac.udn.vn