Home
Giới thiệu
Tài khoản
Đăng nhập
Quên mật khẩu
Đổi mật khẩu
Đăng ký tạo tài khoản
Liệt kê
Công trình khoa học
Bài báo trong nước
Bài báo quốc tế
Sách và giáo trình
Thống kê
Công trình khoa học
Bài báo khoa học
Sách và giáo trình
Giáo sư
Phó giáo sư
Tiến sĩ
Thạc sĩ
Lĩnh vực nghiên cứu
Tìm kiếm
Cá nhân
Nội dung
Góp ý
Hiệu chỉnh lý lịch
Thông tin chung
English
Đề tài NC khoa học
Bài báo, báo cáo khoa học
Hướng dẫn Sau đại học
Sách và giáo trình
Các học phần và môn giảng dạy
Giải thưởng khoa học, Phát minh, sáng chế
Khen thưởng
Thông tin khác
Tài liệu tham khảo
Hiệu chỉnh
Số người truy cập: 109,894,561
Development of short tandem repeat (STR) and derived cleaved amplified polymorphic (dCAPS) markers for distinguishing species and varieties of the genus
Panax
in Vietnam
Tác giả hoặc Nhóm tác giả:
Dinh Xuan Tu, Mai Xuan Cuong, Nguyen Minh Ly
Nơi đăng:
Genetic Resources and Crop Evolution;
S
ố:
2023;
Từ->đến trang
: https://doi.org/10.1007/s10722-023-01557-0;
Năm:
2023
Lĩnh vực:
Nông lâm ngư;
Loại:
Bài báo khoa học;
Thể loại:
Quốc tế
TÓM TẮT
In this study, we developed a protocol for the authentication of
Panax vietnamensis
var.
vietnamensis
(Ngoc Linh ginseng) by combining two molecular markers: short tandem repeat (STR) and derived cleaved amplified polymorphic sequences (dCAPS). STR markers: Pvm30 and Pvm31 were found in the chloroplast genome of
P. vietnamensis
var.
vietnamensis
. These markers were able to accurately identify
Panax stipuleanatus
,
Panax vietnamensis
var.
fuscidiscus
, and
Panax ginseng
.
Panax vietnamensis
var.
vietnamensis
and
Panax vietnamensis
var.
langbianensis
had a high similarity of chloroplast genomic sequence (99.96%) leading to STR markers could not distinguish these two ginseng varieties. Therefore, dCAPS marker: PvmdCAPS was applied to compensate for the defect of the STR markers. From the alignment result of the
mat
K coding sequences of these two varieties, PvmdCAPS primers were designed at the position of single nucleotide polymorphisms (SNP) at the 248th nucleotide and had the ability to discriminate between these two
Panax
varieties. In summary, the combination of STR and dCAPS was used to distinct
Panax
species in Vietnam, especially
P. vietnamensis
var.
vietnamensis
.
ABSTRACT
In this study, we developed a protocol for the authentication of
Panax vietnamensis
var.
vietnamensis
(Ngoc Linh ginseng) by combining two molecular markers: short tandem repeat (STR) and derived cleaved amplified polymorphic sequences (dCAPS). STR markers: Pvm30 and Pvm31 were found in the chloroplast genome of
P. vietnamensis
var.
vietnamensis
. These markers were able to accurately identify
Panax stipuleanatus
,
Panax vietnamensis
var.
fuscidiscus
, and
Panax ginseng
.
Panax vietnamensis
var.
vietnamensis
and
Panax vietnamensis
var.
langbianensis
had a high similarity of chloroplast genomic sequence (99.96%) leading to STR markers could not distinguish these two ginseng varieties. Therefore, dCAPS marker: PvmdCAPS was applied to compensate for the defect of the STR markers. From the alignment result of the
mat
K coding sequences of these two varieties, PvmdCAPS primers were designed at the position of single nucleotide polymorphisms (SNP) at the 248th nucleotide and had the ability to discriminate between these two
Panax
varieties. In summary, the combination of STR and dCAPS was used to distinct
Panax
species in Vietnam, especially
P. vietnamensis
var.
vietnamensis
.
© Đại học Đà Nẵng
Địa chỉ: 41 Lê Duẩn Thành phố Đà Nẵng
Điện thoại: (84) 0236 3822 041 ; Email: dhdn@ac.udn.vn