Thông tin chung
  English
  Đề tài NC khoa học
  Bài báo, báo cáo khoa học
  Hướng dẫn Sau đại học
  Sách và giáo trình
  Các học phần và môn giảng dạy
  Giải thưởng khoa học, Phát minh, sáng chế
  Khen thưởng
  Thông tin khác
  Tài liệu tham khảo
  Hiệu chỉnh
 
Số người truy cập: 109,880,920

 Mô hình phương trình vi phân phi tuyến để định lượng qui luật phiên mã được áp dụng cho dữ liệu microarray của Saccharomyces cerevisiae
Tác giả hoặc Nhóm tác giả: Tra Thi Vu, Jiri Vohradsky
Nơi đăng: Nucleic acids research, Oxford University Press; Số: 35 (1);Từ->đến trang: 279-287;Năm: 2007
Lĩnh vực: Khoa học; Loại: Bài báo khoa học; Thể loại: Quốc tế
TÓM TẮT
ABSTRACT
Microarray studies are capable of providing data for temporal gene expression patterns of thousands of genes simultaneously, comprising rich but cryptic information about transcriptional control. However available methods are still not adequate in extraction of useful information about transcriptional regulation from these data. This study presents a dynamic model of gene expression which allows for identification of transcriptional regulators using time series of gene expression. The algorithm was applied for identification of transcriptional regulators controlling 40 cell cycle regulated genes of Saccharomyces cerevisiae . The presented algorithm uses a dynamic model of time continuous gene expression with the assumption that the target gene expression profile results from the action of the upstream regulator. The goal is to apply the model to putative regulators to estimate the transcription pattern of a target gene using a least squares minimization procedure. The procedure iteratively tests all possible transcription factors and selects those that best approximate the target gene expression profile. Results were compared with independently published data and good agreement between the published and identified transcriptional regulators was found.
© Đại học Đà Nẵng
 
 
Địa chỉ: 41 Lê Duẩn Thành phố Đà Nẵng
Điện thoại: (84) 0236 3822 041 ; Email: dhdn@ac.udn.vn