Thông tin chung
  English
  Đề tài NC khoa học
  Bài báo, báo cáo khoa học
  Hướng dẫn Sau đại học
  Sách và giáo trình
  Các học phần và môn giảng dạy
  Giải thưởng khoa học, Phát minh, sáng chế
  Khen thưởng
  Thông tin khác
  Tài liệu tham khảo
  Hiệu chỉnh
 
Số người truy cập: 109,882,820

 ĐÁNH GIÁ VÀ SO SÁNH CÁC GIẢI THUẬT BIỂU DIỄN CẤU TRÚC BẬC HAI CỦA RNA
Tác giả hoặc Nhóm tác giả: Đoàn Duy BìnhPhạm Minh TuấnĐặng Đức Long
Nơi đăng: Tạp chí khoa học Đại học Huế; Số: 7-A, 2016;Từ->đến trang: 5-20;Năm: 2016
Lĩnh vực: Công nghệ thông tin; Loại: Bài báo khoa học; Thể loại: Trong nước
TÓM TẮT
Hiển thị các cấu trúc bậc hai RNA trên không gian 2 chiều là một phương pháp quan trọng nhất để hiểu RNA. Có rất nhiều phương pháp thông thường để hiển thị cấu trúc bậc hai RNA như phương pháp tuyến tính, phương pháp tròn và phương pháp lan tỏa. Bài viết này miêu tả tổng quát các định nghĩa của cấu trúc bậc hai RNA và các phương pháp thông thường để hiển thị cấu trúc bậc hai RNA trên không gian 2 chiều. Đầu tiên, bài viết này giới thiệu 3 thuật toán thông thường. Thứ hai, đánh giá và so sánh các cách biểu diễn của các thuật toán trên cơ sở sử dụng 3 chuỗi RNA. Sau đó, bài viết này đề xuất thuật toán tốt nhất để hiển thị cấu trúc bậc hai RNA trên không gian 2 chiều. Kết quả thử nghiệm cho thấy phương pháp lan tỏa có hiệu suất cao hơn so với các phương pháp hiển thị khác.
ABSTRACT
Displaying the RNA secondary structure on 2-dimentional space is a most important method to undestand RNA. There are many conventional method to display the RNA secondary structure such as linear method, circular method and radiate method. This paper overviews the difinitions of RNA secondary structure and the conventional methods to display the RNA secondary structure on 2-dimentional space. First, this paper introduces 3 conventional algorithms. Second, it evaluates and compares the performances of these algorithms using 3 RNA sequences. Then, this paper proposes best algorithm to display the RNA secondary structure on 2-dimentional space. The experimental result shows that radiate method has higher performance than other displaying methods.
© Đại học Đà Nẵng
 
 
Địa chỉ: 41 Lê Duẩn Thành phố Đà Nẵng
Điện thoại: (84) 0236 3822 041 ; Email: dhdn@ac.udn.vn